Значи трудно се разбира какво точно питаш че нещо си изпуснал в писането си точки и запетайки, но  ако търсиш къде ти е проблема в задачата то отговора е в "int a=Scanner.nextInt();"

Когато въвеждаш Integer  трябва да изглежда така: 

int a=Integer.parseInt(scanner.nextLine());

Освен това Scanner scanner = new Scanner(System.in); трябва да е на един ред а ти си го смъкна на втори с един излишен Scanner.

Реално кода ти трябва да изглежда така:

import java.util.Scanner;


public class SquareArea1{
    public static void main(String[]args){
    Scanner scanner = new Scanner(System.in);

System.out.print("a=");
    int a=Integer.parseInt(scanner.nextLine());
    int area=a*a;
System.out.print("area=");
System.out.println(area);
}
}

Просто оправих Scanner  както и Integer и работи, надявам се да съм бил полезен с обяснението. Поздрави