Значи грешките са ти три: 

Първата е че имаш една грешно зададена стойност :

1. else if (tochki >1000) {

2.                 bonustochki = 0.2 * tochki;}

3.  

4.             else if (tochki > 1000){

5.                 bonustochki = 0.1 * tochki;

Ти вече имаш една такава проверка, защо са ти две?  В този случай проверката е над 1000, обаче ако въведеш число над 100 и по малко от 1000 то според твоя код нямаш решение, едното трябва да е <1000: 

1. else if (tochki < 1000){

2.                 bonustochki = 0.2 * tochki;}

Другите ти две грешки са в този код:

1.  if  (tochki % 2 == 0) {

2.             bonustochki= +1;}

3.              else if (tochki % 5 == 0){

4.                 bonustochki = +2;

 Пишеш че бонус точките са равни на +2, но това не е валидно уравнение, трябва да бъде bonustochki = bonustochki + 2; и в двата реда за да върви задачата, или ако си решил да спестиш малко писане то тогава плюса се слага преди знака за =:

или ще изглежда така: bonustochki += 2;

За да разбереш ето ти поправения код който минава със 100 в Джъдж:

https://pastebin.com/0XB85BvC 

Дано да съм ти обяснил правилно и съм бил полезен, поздрави :)